Пуерто-Мальдонадо (ісп. Puerto Maldonado) — південно-східне місто Перу неподалеку від кордону з Бразилією й у 55 км від болівійського кордону.
Адміністративний центр регіону Мадре-де-Дьос.
Місто розташоване в місці злиття рік Мадре де Дьос (притока ріки Амазонки) й Тамбопата, приблизно в 400 километрах на схід від Куско. Пуерто-Мальдонадо є портовим містом, униз від якого починається судноплавтво річкою.
Місто Пуерто-Мальдонадо часто називають «південною столицею перуанської Амазонії» й «світовою столицею флори й фауни», саме він є воротами для відвідин Національного парку Ману, визнаного в 1987 році ЮНЕСКО — Натуральною Спадщиною Людства, та національного заповідника Тамбопата-Кандамо, які славляться великою різноманітністю флори й дикої фауни джунглів.